Obgleich die Basilika einer umfassenden baulichen Veränderung unterzogen wurde, lässt sich ihr romanischer Baustil nach wie vor deutlich erkennen. Der im Jahr 1180 errichtete Bau weist starke künstlerische Parallelen zur Wartburg auf. Im Laufe der Zeit wurde die Kirche wiederholt umgebaut. Die dreischiffige romanische Basilika fungierte als Pfarr- und Klosterkirche.
Zusammen mit dem Nikolaitor prägt sie das Bild des Karlsplatzes. Von den ehemals fünf Stadttoren ist lediglich das romanische Nikolaitor erhalten geblieben. Bis 1832 wurden die Stadttore allabendlich geschlossen. Das Nikolaitor stammt aus der Zeit um 1170. An dieser Stelle betrat Martin Luther im Jahr 1498 die Stadt.


Neben dem romanischen Taufstein stellt das um 1510/1520 entstandene Altarretabel das wichtigste Ausstattungsstück dar.


Das Altarretabel zeigt im Mittelschrein die Beweinung Christi. Neben dem Relief sind die Heiligen Nikolaus und Jakobus dargestellt. Der Sockel, der mit einer kunstvollen Malerei versehen ist, zeigt Johannes und Maria, welche dem Betrachter Christus präsentieren.