Herrschaft von Rimini (1334-1528)
Sie und ihr Gatte waren bereits durch die Heirat seiner Schwester Elisabetta mit ihrem Bruder Carlo verwandt . Francescos erste Frau Agnese Visconti war 1391 wegen Untreue hingerichtet worden. Margherita und Francesco I. waren die Eltern von Gianfrancesco I., dem ersten Markgrafen von Mantua . Gianfrancesco heiratete 1409 Paola Malatesta , die Tochter von Malatesta IV .

Das Netzwerk der verwandten Frauen Margherita Malatesta, Alda d'Este sowie Elisabetta und Margherita Gonzaga soll die Höfe von Mantua, Ferrara , Rimini und Pesaro miteinander verbunden haben . Die Familie Gonzaga prägte Medaillen von Margherita. Margherita brachte die Erbkrankheit Rachitis zu den Gonzagas, die bis ins 16. Jahrhundert regelmäßig bei den Herren von Mantua auftrat. Sie starb am 28. Februar 1399 und wurde in der Kirche San Francesco in Mantua im Mausoleum der Gonzagas beigesetzt.
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