Dès le XIᵉ siècle, le vallon de Bellefontaine accueille une vie monastique érémitique, bientôt suivie par l'installation d'une communauté bénédictine. Les « moines noirs » y demeurent jusqu'au milieu du XVIIᵉ siècle, avant de céder la place aux cisterciens feuillants. Dispersés par la Révolution française, ces derniers voient leur monastère gravement endommagé durant les Guerres de Vendée.

En 1816, les trappistes réinvestissent les lieux et entreprennent la reconstruction complète de l'abbaye sur son emplacement d'origine. Les « moines blancs » y vivent pendant plus de deux siècles. Faute de vocations suffisantes, ils quittent Bellefontaine en 2025.

Le 11 juillet 2026, douze moines bénédictins issus de l'abbaye Sainte-Madeleine du Barroux, en Provence, s'installent à Bellefontaine. Ils assurent désormais la continuité de la vie monastique et de la prière dans ce lieu où des communautés religieuses se succèdent depuis près de mille ans.